Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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