Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TGFB2-201ENST00000366929 5053 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 IGKV1D-42-201ENST00000390278 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 Z98751.1-201ENST00000413827 381 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SRGAP3-AS3-201ENST00000432981 1223 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 APOA2-203ENST00000463812 401 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MNX1-204ENST00000469500 209 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SL318P-201ENST00000471955 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 BPI-205ENST00000479646 383 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SL584P-201ENST00000492309 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 TAS2R38-201ENST00000547270 1143 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC009053.4-201ENST00000614366 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CCDC181-202ENST00000367806 1860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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