Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms