Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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