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| RUNX3 | Q13761 | AC073284.1-201 | ENST00000448086 | 404 nt | TSL 3 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND3P4-201 | ENST00000453537 | 303 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DHFRP3-201 | ENST00000455595 | 559 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007537.2-201 | ENST00000472093 | 511 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB109A-201 | ENST00000482450 | 265 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01332-201 | ENST00000506612 | 502 nt | TSL 4 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016598.2-201 | ENST00000514942 | 525 nt | TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1334P-201 | ENST00000516032 | 105 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AP003730.1-201 | ENST00000524605 | 285 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157938.2-205 | ENST00000586290 | 891 nt | TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC024941.1-201 | ENST00000612250 | 334 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513314.2-206 | ENST00000617276 | 434 nt | TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FOXP2-217 | ENST00000462331 | 1388 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLCN5-202 | ENST00000376088 | 10108 nt | TSL 2 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDC23-202 | ENST00000394886 | 3155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP1R9A-201 | ENST00000289495 | 3983 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMD12-202 | ENST00000409003 | 8866 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP290-202 | ENST00000397838 | 2421 nt | TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EDA2R-202 | ENST00000374719 | 3418 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513548.1-201 | ENST00000562904 | 1724 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01289-201 | ENST00000519550 | 3712 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XIRP2-207 | ENST00000628543 | 12182 nt | TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KTN1-202 | ENST00000395308 | 4134 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNMT-209 | ENST00000592764 | 4108 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNTRL-205 | ENST00000373850 | 5824 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.62-201 | ENST00000362840 | 99 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP27-201 | ENST00000410684 | 333 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPFP1-201 | ENST00000414761 | 252 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF240627.1-201 | ENST00000416002 | 879 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451107.1-201 | ENST00000416310 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC4A1APP1-201 | ENST00000419995 | 602 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CKS1BP6-201 | ENST00000424932 | 240 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPM1P26-201 | ENST00000426339 | 738 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCTD10P1-201 | ENST00000434203 | 625 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z85994.2-201 | ENST00000434327 | 452 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012671.1-201 | ENST00000451912 | 203 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7AP52-201 | ENST00000458096 | 790 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FPGT-203 | ENST00000467578 | 601 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093801.1-201 | ENST00000504017 | 307 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026401.1-201 | ENST00000549756 | 530 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074050.1-201 | ENST00000563247 | 211 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010547.7-201 | ENST00000570323 | 333 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1254-2-201 | ENST00000579553 | 63 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113403.1-201 | ENST00000604910 | 193 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012467.1-201 | ENST00000607740 | 256 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104820.1-201 | ENST00000624183 | 307 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATXN3-207 | ENST00000503767 | 1315 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL929601.4-201 | ENST00000613011 | 1341 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MDM2-201 | ENST00000258148 | 1361 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005261.4-201 | ENST00000600047 | 1385 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00622-201 | ENST00000562811 | 1570 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP3A43-204 | ENST00000354829 | 1709 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF2AP4-201 | ENST00000424793 | 1781 nt | BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL1R1-202 | ENST00000409329 | 1862 nt | TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PUS7L-203 | ENST00000431332 | 1873 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DCX-202 | ENST00000358070 | 9405 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GABRG2-202 | ENST00000361925 | 3767 nt | TSL 3 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTUS1-203 | ENST00000381861 | 3996 nt | APPRIS P4 TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DGKH-206 | ENST00000536612 | 3957 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERBIN-208 | ENST00000506030 | 4386 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ETV1-205 | ENST00000405192 | 4402 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP1R9A-207 | ENST00000433881 | 9928 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP112-204 | ENST00000537949 | 2847 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CUL2-201 | ENST00000374746 | 3903 nt | TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C18orf54-202 | ENST00000382911 | 4056 nt | TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP152-203 | ENST00000399334 | 5097 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008033.1-201 | ENST00000216407 | 1162 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLCA1-201 | ENST00000234701 | 3310 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KRTAP24-1-201 | ENST00000340345 | 1650 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMMR-202 | ENST00000358715 | 2988 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-132P-201 | ENST00000364300 | 164 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBBP2-201 | ENST00000376781 | 231 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EYA1-205 | ENST00000388742 | 3907 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAH6-202 | ENST00000389394 | 12795 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRRF-208 | ENST00000394315 | 1501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC017048.1-201 | ENST00000412153 | 495 nt | TSL 2 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121878.1-201 | ENST00000418638 | 859 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC064875.1-202 | ENST00000421112 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010967.1-201 | ENST00000421575 | 489 nt | TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POU6F2-AS1-201 | ENST00000433519 | 381 nt | TSL 3 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM244-202 | ENST00000438392 | 565 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL48P1-201 | ENST00000445390 | 636 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005518.1-201 | ENST00000448131 | 1116 nt | TSL 2 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RHEBP2-201 | ENST00000450289 | 600 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LMOD2-202 | ENST00000458573 | 2346 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC089999.1-201 | ENST00000460336 | 374 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079910.1-201 | ENST00000477099 | 749 nt | TSL 3 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCTD9P6-201 | ENST00000522306 | 950 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107373.1-201 | ENST00000522570 | 603 nt | TSL 3 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VNN2-207 | ENST00000525289 | 900 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001267.1-201 | ENST00000531742 | 2074 nt | TSL 2 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049874.4-201 | ENST00000557593 | 255 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022523.3-201 | ENST00000559643 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090515.3-201 | ENST00000560431 | 315 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |