Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms