Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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