Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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