Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC048344.3-201ENST00000605512 251 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ADAM3A-208ENST00000495171 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 STAT4-201ENST00000358470 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 GLULP5-201ENST00000547831 1390 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CNR1-204ENST00000428600 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PTPN20-205ENST00000395721 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LPL-201ENST00000311322 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RPSAP8-201ENST00000429844 889 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RPL26P34-201ENST00000431005 451 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AL450311.1-201ENST00000434931 576 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AL590609.1-201ENST00000442164 328 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 IGKV1-16-201ENST00000479981 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC005722.3-201ENST00000580884 446 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RBMS3-AS2-207ENST00000629416 456 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MAPK10-301ENST00000641313 2482 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CERS6-AS1-201ENST00000425636 2890 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AL121936.1-201ENST00000641660 2884 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC01856-201ENST00000450840 2398 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 C1orf116-202ENST00000461135 3142 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ANKUB1-201ENST00000446160 2419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MSL3P1-201ENST00000438684 2032 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CYCSP5-201ENST00000415043 297 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PHBP7-201ENST00000415677 814 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC073346.1-202ENST00000430610 544 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 Z97634.1-203ENST00000435229 471 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC091808.1-201ENST00000438867 786 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC018638.4-201ENST00000465971 1150 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms