Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD12P35452 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD12P35452 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD12P35452 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD12P35452 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD12P35452 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD12P35452 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD12P35452 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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HOXD12P35452 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD12P35452 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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