Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRGP23470 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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