Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 NELL1-203ENST00000357134 3022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 POLD3-201ENST00000263681 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRHP20396 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 CTNNA2-203ENST00000402739 3684 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 CASP4-203ENST00000444739 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC063949.2-201ENST00000508671 1968 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRHP20396 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TRHP20396 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
TRHP20396 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
TRHP20396 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 LINC01140-201ENST00000461990 3181 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TRHP20396 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms