Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD8P13378 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms