Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PUM3Q15397 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms