Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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