Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms