Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CNGB1Q14028 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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