Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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