Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LINC01998-201ENST00000464673 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ENTHD1-201ENST00000325157 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 CHRM3-207ENST00000615928 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RASGEF1B-213ENST00000613784 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 C1orf74-201ENST00000294811 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 GUCY1B3-201ENST00000264424 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 SLC9B2-203ENST00000503103 1911 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 VPS45-202ENST00000369130 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 LINC00484-205ENST00000423719 3023 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 SYTL4-202ENST00000276141 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 NREP-201ENST00000257435 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 AL031590.1-203ENST00000642075 2747 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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HOXD11P31277 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 MYRIP-210ENST00000539167 4635 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 INTS9-211ENST00000521022 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 BCAS1-202ENST00000395961 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ADAM3A-208ENST00000495171 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ITGBL1-201ENST00000376162 2007 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 NECAP1-219ENST00000639811 2175 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HOXD11P31277 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC011095.1-201ENST00000584677 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 GPATCH4-201ENST00000368232 1972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SNORA42.2-201ENST00000384771 134 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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