Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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