Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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