Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PRPF4BQ13523 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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