Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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TCIRG1Q13488 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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