Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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ITGB3BPQ13352 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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