Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms