Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms