Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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HOXD10P28358 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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HOXD10P28358 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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HOXD10P28358 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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