Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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H2AFJQ9BTM1 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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H2AFJQ9BTM1 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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H2AFJQ9BTM1 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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H2AFJQ9BTM1 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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H2AFJQ9BTM1 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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H2AFJQ9BTM1 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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H2AFJQ9BTM1 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2AFJQ9BTM1 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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