Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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