Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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