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| BRD3 | Q15059 | MTCYBP15-201 | ENST00000433123 | 1127 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC234064.1-201 | ENST00000436312 | 247 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | CLEC5A-202 | ENST00000438351 | 743 nt | TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01035-201 | ENST00000445072 | 784 nt | TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | BTF3P6-201 | ENST00000448054 | 499 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP006222.1-205 | ENST00000450734 | 457 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL122019.1-202 | ENST00000458070 | 546 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC131211.1-201 | ENST00000497285 | 483 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC068880.2-201 | ENST00000521016 | 362 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
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| BRD3 | Q15059 | NAV2-AS3-201 | ENST00000534036 | 598 nt | TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC130404.1-201 | ENST00000539362 | 739 nt | TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL132800.1-201 | ENST00000555109 | 698 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC012170.3-201 | ENST00000560159 | 297 nt | TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC02137-203 | ENST00000567448 | 930 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC099850.2-201 | ENST00000577660 | 557 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC233702.9-201 | ENST00000581528 | 203 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011840.5-201 | ENST00000582125 | 771 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC063944.1-210 | ENST00000593837 | 519 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | SSX4B-201 | ENST00000595235 | 1221 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | SSX4-201 | ENST00000595689 | 1221 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC244107.2-201 | ENST00000611773 | 76 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | VN1R74P-201 | ENST00000613259 | 503 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | NADK2-211 | ENST00000617628 | 744 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC015914.2-201 | ENST00000618167 | 288 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC135068.5-201 | ENST00000624197 | 983 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01320-210 | ENST00000626008 | 929 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR1910-201 | ENST00000636955 | 80 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008703.1-201 | ENST00000637629 | 1174 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | GPATCH2L-214 | ENST00000621494 | 12396 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNF133-201 | ENST00000340112 | 1445 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM111A-201 | ENST00000361723 | 3592 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | GABRG2-217 | ENST00000639384 | 5360 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | CTAGE5-210 | ENST00000553728 | 4392 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | EIF3E-206 | ENST00000519030 | 1324 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP4S1-212 | ENST00000622409 | 4113 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MAP3K7-203 | ENST00000369327 | 4558 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | CARF-208 | ENST00000428585 | 2513 nt | TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC12A1-205 | ENST00000558405 | 3426 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | INPP4B-201 | ENST00000262992 | 3741 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINS1-201 | ENST00000314742 | 4821 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | GAPT-201 | ENST00000318469 | 2119 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | CFHR3-205 | ENST00000471440 | 1965 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01625-201 | ENST00000454788 | 1690 nt | TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | CLEC1A-204 | ENST00000457018 | 1686 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | TSPAN8-202 | ENST00000393330 | 1516 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC025263.3-201 | ENST00000622965 | 1396 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR55B1P-203 | ENST00000641518 | 2602 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MOSPD2-201 | ENST00000380492 | 4163 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR99AHG-219 | ENST00000619222 | 3476 nt | TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MRPS36-201 | ENST00000256441 | 1286 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | PPIG-201 | ENST00000260970 | 6368 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | CLEC2D-201 | ENST00000261339 | 465 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR9G4-201 | ENST00000302957 | 984 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | BMS1P3-201 | ENST00000372011 | 932 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP16-201 | ENST00000410180 | 299 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGN1P20-201 | ENST00000411849 | 300 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01945-201 | ENST00000419784 | 840 nt | TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092634.2-201 | ENST00000428146 | 1010 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005208.1-201 | ENST00000435112 | 599 nt | TSL 3 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00972-202 | ENST00000438065 | 788 nt | TSL 3 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01986-201 | ENST00000440867 | 590 nt | TSL 5 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | KRTAP21-3-201 | ENST00000444335 | 253 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL7L1P1-201 | ENST00000448259 | 785 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00448-202 | ENST00000448411 | 433 nt | TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC233982.1-201 | ENST00000451247 | 436 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRBV2-201 | ENST00000455382 | 421 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AF129075.1-201 | ENST00000457162 | 794 nt | TSL 3 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR2A1-AS1-202 | ENST00000467944 | 422 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL32P33-201 | ENST00000487023 | 394 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | SEMA6A-AS2-201 | ENST00000508766 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | HPRT1P1-201 | ENST00000509498 | 657 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC122710.1-201 | ENST00000510622 | 553 nt | TSL 5 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD116-26-201 | ENST00000516006 | 96 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-276P-201 | ENST00000516114 | 96 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | OPRM1-223 | ENST00000524163 | 1251 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02399-201 | ENST00000547094 | 400 nt | TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | HAGLR-211 | ENST00000549329 | 609 nt | TSL 4 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090888.3-201 | ENST00000558917 | 509 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC114546.1-201 | ENST00000560140 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC134669.2-201 | ENST00000578584 | 1008 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4512-201 | ENST00000583257 | 77 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008395.1-201 | ENST00000601752 | 607 nt | TSL 5 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091057.3-201 | ENST00000602684 | 733 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091488.1-201 | ENST00000604239 | 660 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC108865.2-201 | ENST00000606881 | 432 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |