Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms