Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms