Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms