Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 KRT7-214ENST00000638501 398 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 BMS1P2-202ENST00000532854 1858 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ANKUB1-201ENST00000446160 2419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC008739.5-201ENST00000623035 1938 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 JAKMIP2-202ENST00000333010 2992 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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