Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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