Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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