Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRGP23470 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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