Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRBP23467 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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