Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms