Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD2APQ9Y5K6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms