Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR3

TBX20, T-box transcription factor TBX20, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX20Q9UMR3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX20Q9UMR3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX20Q9UMR3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms