Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARP4Q9UKK3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms