Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPUSD1Q9UJJ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms