Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACL1Q9UJ83 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms