Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms