Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms