Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX20Q9UHI6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms