Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms