Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms