Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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