Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms